התשובה תלויה בגודל החברה מקבלת ההטבה, כאשר ההוראות עושות הבחנה בין חברה גדולה לעומת חברה קטנה. כמו כן שיעור התמלוגים תלוי במועד קבלת המענק- האם התקבל לפני 1.7.2017 (מועד כניסת ההוראות החדשות) לפירוט והרחבה יש לפנות לנספח ד הוראות לעניין שיעור התמלוגים וכללים לתשלומם נוהל דיווח ותשלום תמלוגים (200-03).
שיעור התמלוגים:
- חברה קטנה תשלם 3% תמלוגים מההכנסה.
- מהי חברה קטנה? חברה שקיבלה אישור או אדם או תאגיד קשור, שהכנסותיה בשנה שקדמה להגשת הבקשה לא עלו על 70 מיליון דולר.
- חברה גדולה תשלם 5% תמלוגים מההכנסה.
- מהי חברה גדולה? חברה שקיבלה אישור או אדם או תאגיד קשור, שהכנסותיה בשנה שקדמה להגשת הבקשה עלו על 70 מיליון דולר.
- חברה שמייצרת בחו”ל ומחיר המוצר הסופי שלה ידוע, תשלם 1% יותר לפי גודלה, 4% ו-6% בהתאמה.
- חברה שמייצרת בחו”ל ומחיר המוצר הסופי שלה לא ידוע, תדווח ותשלם לפי יחס עלויות השקעה בייצור המוצר. כלומר: חלק השקעת רשות החדשנות מכלל הוצאות המו”פ.