מעיין הכהן משמשת כראש מטה מנכ״ל ברשות החדשנות ומובילה את עבודת המטה, גיבוש סדרי העדיפויות הארגוניים וקידום תהליכים רוחביים מורכבים. במסגרת תפקידה היא פועלת לחיבור אפקטיבי בין מדיניות, תכנון וביצוע, להסרת חסמים ולקידום שיתופי פעולה.
טרם הצטרפותה לרשות החדשנות כיהנה בתפקידי מטה וניהול בכירים בשירות הציבורי. בין היתר שימשה כמנהלת יחידה ברשות התאגידים וכרגולטורית בתחום, והובילה תהליכים רגולטוריים ואסטרטגיים, לרבות גיבוש מדיניות, קידום חקיקה והקמת תשתיות ארגוניות. קודם לכן שימשה כיועצת למשנה לפרקליט המדינה (אזרחי), ניהלה צוותי מטה, הייתה שותפה לגיבוש אסטרטגיה ארגונית, הובילה טרנספורמציה דיגיטלית רחבת היקף וניהלה ממשקים עם דרגים בכירים במערכת המשפט ובמשרדי הממשלה.
מעיין עורכת דין בהכשרתה, בוגרת תואר ראשון במשפטים בהצטיינות יתרה ותואר שני במנהל ומדיניות ציבורית בהצטיינות מאוניברסיטת בר־אילן. היא התמחתה במחלקת הבג״צים בפרקליטות המדינה ומביאה עמה ניסיון עשיר בהובלת תהליכי שינוי וחיבור בין חזון, מדיניות ויישום.