רשות החדשנות עוקבת אחר התפתחות אקוסיסטם החדשנות בישראל ומעדכנת בהתאם את המדיניות שלה ואת כלי התמיכה שלה בתעשייה. חטיבת אסטרטגיה וכלכלה ברשות מספקת תמיכה מתמשכת לתהליכים אלו, באמצעות פעילויות מחקר, תכנון, הערכה ובקרה תקציבית.